Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HRCP23327 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HRCP23327 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HRCP23327 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HRCP23327 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HRCP23327 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HRCP23327 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms