Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FGFR3P22607 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms