Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms