Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNNI3P19429 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms