Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD53P19397 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD53P19397 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD53P19397 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD53P19397 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms