Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms