Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR1P18146 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms