Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms