Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NME1P15531 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME1P15531 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME1P15531 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms