Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2F2P13984 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms