Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRG2P13727 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRG2P13727 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms