Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD8P13378 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms