Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms