Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms