Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4BP0C0L5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms