Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms