Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJB1P08034 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJB1P08034 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GJB1P08034 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms