Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPBP07988 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms