Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms