Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVILO95425 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVILO95425 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVILO95425 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVILO95425 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVILO95425 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVILO95425 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SVILO95425 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms