Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBBP9O75884 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms