Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRMUO75648 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRMUO75648 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms