Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA0556O60303 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms