Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms