Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRGAP3O43295 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms