Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASKO14936 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASKO14936 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASKO14936 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASKO14936 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms