Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSPB6O14558 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB6O14558 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms