Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPIPB9F8W1W9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms