Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms