Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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