Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms