Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms