Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms