Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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