Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SERP1Q9Y6X1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms