Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms