Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms