Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms