Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms