Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APEX2Q9UBZ4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms