Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms