Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDP1Q9P0J1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDP1Q9P0J1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms