Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHMP5Q9NZZ3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHMP5Q9NZZ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms