Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VSX1Q9NZR4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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