Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GDAP2Q9NXN4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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