Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM106BQ9NUM4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms