Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms