Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms