Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSHZ2Q9NRE2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSHZ2Q9NRE2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSHZ2Q9NRE2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSHZ2Q9NRE2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms