Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms